FC931030
Overview
Libraries
Analyses
This EST is derived from or has results from the following analyses
Alignments
Homology
BLAST of FC931030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_ARATH (Elongation factor 1-alpha OS=Arabidopsis thaliana GN=A1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 456.447 bits (1173), Expect = 6.705e-128 Identity = 221/230 (96.09%), Postives = 229/230 (99.57%), Query Frame = 1 Query: 22 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMIVTFGPSGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVSVKDLKRGYVASNSKDDPAKGASNFTSQ 711 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEI+KEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRP+DKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETG++KPGM+VTF P+GLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNV+VKDLKRGYVASNSKDDPAKGA+NFTSQ Sbjct: 102 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIIKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGMIKPGMVVTFAPTGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVAVKDLKRGYVASNSKDDPAKGAANFTSQ 331
BLAST of FC931030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_WHEAT (Elongation factor 1-alpha OS=Triticum aestivum GN=TEF1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 453.751 bits (1166), Expect = 4.346e-127 Identity = 220/230 (95.65%), Postives = 229/230 (99.57%), Query Frame = 1 Query: 22 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMIVTFGPSGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVSVKDLKRGYVASNSKDDPAKGASNFTSQ 711 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARY+EIVKEVSSYLKKVGYNPDK+PFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRP+DKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGV+KPGM+VTFGP+GLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNV+VKDLKRG+VASNSKDDPAK A+NFTSQ Sbjct: 102 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYEEIVKEVSSYLKKVGYNPDKVPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVIKPGMVVTFGPTGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVAVKDLKRGFVASNSKDDPAKEAANFTSQ 331
BLAST of FC931030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_SOLLC (Elongation factor 1-alpha OS=Solanum lycopersicum PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 453.751 bits (1166), Expect = 4.346e-127 Identity = 220/230 (95.65%), Postives = 229/230 (99.57%), Query Frame = 1 Query: 22 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMIVTFGPSGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVSVKDLKRGYVASNSKDDPAKGASNFTSQ 711 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRP+DKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGV+KPGM+VTFGP+GLTTEVKSVEMHHE+L EALPGDNVGFNVKNV+VKDLKRGYVASNSKDDPAKGA++FT+Q Sbjct: 102 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVIKPGMVVTFGPTGLTTEVKSVEMHHEALQEALPGDNVGFNVKNVAVKDLKRGYVASNSKDDPAKGAASFTAQ 331
BLAST of FC931030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_ORYSJ (Elongation factor 1-alpha OS=Oryza sativa subsp. japonica GN=REFA1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 453.751 bits (1166), Expect = 4.346e-127 Identity = 222/230 (96.52%), Postives = 228/230 (99.13%), Query Frame = 1 Query: 22 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMIVTFGPSGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVSVKDLKRGYVASNSKDDPAKGASNFTSQ 711 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRP+DKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGM+VTFGPSGLTTEVKSVEMHHE+L EALPGDNVGFNVKNV+VKDLKRGYVASNSKDDPAK A++FTSQ Sbjct: 102 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFGPSGLTTEVKSVEMHHEALQEALPGDNVGFNVKNVAVKDLKRGYVASNSKDDPAKEAASFTSQ 331
BLAST of FC931030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A1_DAUCA (Elongation factor 1-alpha OS=Daucus carota PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 451.44 bits (1160), Expect = 2.157e-126 Identity = 220/230 (95.65%), Postives = 227/230 (98.70%), Query Frame = 1 Query: 22 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMIVTFGPSGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVSVKDLKRGYVASNSKDDPAKGASNFTSQ 711 MITGTSQADCAVLIID TTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNP+KI FVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLL+ALDQINEPKRP+DKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETG +KPGM+VTFGPSGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVSVKDLKRGYVASNSKDDPAKGA++FTSQ Sbjct: 102 MITGTSQADCAVLIIDPTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPEKIAFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDQINEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGTIKPGMVVTFGPSGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVSVKDLKRGYVASNSKDDPAKGAASFTSQ 331
BLAST of FC931030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_TOBAC (Elongation factor 1-alpha OS=Nicotiana tabacum PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 449.899 bits (1156), Expect = 6.276e-126 Identity = 219/230 (95.22%), Postives = 228/230 (99.13%), Query Frame = 1 Query: 22 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMIVTFGPSGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVSVKDLKRGYVASNSKDDPAKGASNFTSQ 711 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQIN+ KRP+DKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGM+VTFGP+GLTTEVKSVEMHHE+L EALPGDNVGFNVKNV+VKDLKRG+VASNSKDDPAKGA++FTSQ Sbjct: 102 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINDAKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFGPTGLTTEVKSVEMHHEALQEALPGDNVGFNVKNVAVKDLKRGFVASNSKDDPAKGAASFTSQ 331
BLAST of FC931030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A2_HORVU (Elongation factor 1-alpha OS=Hordeum vulgare GN=BLT63 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 449.514 bits (1155), Expect = 8.196e-126 Identity = 217/230 (94.35%), Postives = 228/230 (99.13%), Query Frame = 1 Query: 22 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMIVTFGPSGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVSVKDLKRGYVASNSKDDPAKGASNFTSQ 711 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVK MICCCNKMDATTPKYSK+RYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDK+PFVPISGFEGDNMIERS+NLDWYKGPTLLEALDQINEPKRP++KPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGV+KPGM+VTFGP+GLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNV+VKDLKRGYVASNSKDDPAK A+NFT+Q Sbjct: 102 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKHMICCCNKMDATTPKYSKSRYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKVPFVPISGFEGDNMIERSSNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPSEKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVIKPGMVVTFGPTGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVAVKDLKRGYVASNSKDDPAKEAANFTAQ 331
BLAST of FC931030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_MANES (Elongation factor 1-alpha OS=Manihot esculenta GN=EF1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 448.743 bits (1153), Expect = 1.398e-125 Identity = 219/230 (95.22%), Postives = 226/230 (98.26%), Query Frame = 1 Query: 22 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMIVTFGPSGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVSVKDLKRGYVASNSKDDPAKGASNFTSQ 711 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQI EPKRP+DKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETG+LKPGM+VTFGP+GLTTEVKSVEMHHE+L EALPGDNVGFNVKNV+VKDLKRG VASNSKDDPAK A+NFTSQ Sbjct: 102 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQIQEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGILKPGMVVTFGPTGLTTEVKSVEMHHEALQEALPGDNVGFNVKNVAVKDLKRGIVASNSKDDPAKEAANFTSQ 331
BLAST of FC931030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A_SOYBN (Elongation factor 1-alpha OS=Glycine max GN=TEFS1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 445.662 bits (1145), Expect = 1.184e-124 Identity = 217/230 (94.35%), Postives = 226/230 (98.26%), Query Frame = 1 Query: 22 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMIVTFGPSGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVSVKDLKRGYVASNSKDDPAKGASNFTSQ 711 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALL+FTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLL+ALDQI+EPKRP+DKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGM+VTF P+GLTTEVKSVEMHHESL EA PGDNVGFNVKNV+VKDLKRGYVASNSKDDPAK A+NFT+Q Sbjct: 102 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLSFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLDALDQISEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMVVTFAPTGLTTEVKSVEMHHESLTEAHPGDNVGFNVKNVAVKDLKRGYVASNSKDDPAKEAANFTAQ 331
BLAST of FC931030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: EF1A1_HORVU (Elongation factor 1-alpha OS=Hordeum vulgare PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 444.891 bits (1143), Expect = 2.019e-124 Identity = 215/230 (93.48%), Postives = 227/230 (98.70%), Query Frame = 1 Query: 22 MITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVLKPGMIVTFGPSGLTTEVKSVEMHHESLLEALPGDNVGFNVKNVSVKDLKRGYVASNSKDDPAKGASNFTSQ 711 MITGTSQADCAVLIIDSTTG F+AGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSK+RYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDK+PFVPISGFEGDNMIERS+NLDWYKGPTLLEALDQINEPKRP+DKPL LPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGV+KPGM+VTFGP+GLTTEVKSVE+HHESLLEALPGDNVGFNVKNV+VKDLKRGYVASNSKDDPAK A+NFT+Q Sbjct: 102 MITGTSQADCAVLIIDSTTGVFQAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKSRYDEIVKEVSSYLKKVGYNPDKVPFVPISGFEGDNMIERSSNLDWYKGPTLLEALDQINEPKRPSDKPLHLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGVIKPGMVVTFGPTGLTTEVKSVEVHHESLLEALPGDNVGFNVKNVAVKDLKRGYVASNSKDDPAKEAANFTAQ 331 The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of FC931030 vs. ExPASy Swiss-Prot
Analysis Date: 2010-05-10 (BLAST: Citrus ESTs to SwissProt) Total hits: 500
Pagesback to topProperties
Sequences
The
following sequences are available for this feature:
EST sequence >FC931030 ID=FC931030; Name=FC931030; organism=Citrus clementina; type=EST; length=719bpback to top |