EVM_prediction_chr2.1_tiancheng.2275

Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>evm.model.chr2.1_tiancheng.2275_cs-GNU_v1 ID=evm.model.chr2.1_tiancheng.2275_cs-GNU_v1; Name=EVM_prediction_chr2.1_tiancheng.2275; organism=Citrus sinensis; type=mRNA; length=771bp
ATGCCGCCATTCATGCCGGTCTCAAAAGCCTTGGGTTCCTTAGTTTCACG
TACAACGGGCAGTAGACATTTGATTAGTTCTGTCAAAAGCGATGGGCAGC
TACGTATGCTCAATCAGTTTCGACGATTGTGTGGAATAACAGGGATCGAA
ACATCTTCAGTCCATAAATTGATTGGTACTCACCAAAATATTAGTTCTTC
ATTAGCTAATTTTTGCCAAAATAATGGTAATGTTCTGCAAAGGAGGCGGT
TTCTTGGTGTCGGAGACGGGGAAGAGGGTGATGTCTTATCCAAAGTTTAT
GAAGAGCGACGTGTTTTAGGCTACTCTCCGGAGCAGTTATTTGATGTAGT
TGCTGCTGTTGATTTGTATCACGGGTTTGTCCCCTGGTGTCAGCGGTCAG
AGATACTGAAACACAACCCAGATGGATCTTTTGATGCCGAGTTGGAGATT
GGGTTTAAATTTCTTGTTGAAAGTTATGTTTCCCACGTGGAGTTAAACAG
ACCAAAGTTCGTTAAGACAACTGCATCAGACAGTTCCCTTTTTGACCATC
TAATAAATATTTGGGAATTCAATCCTGGACCTTCTCCTGGAACTTGCAAC
CTGTACTTTTTGGTGGATTTTAAGTTTCACTCACCACTTTATCGACAGGC
AGCGTCTATGTTCTTTAAGGAGGTGGTCTCTCGATTGGTTGGCTCGTTCA
GTGAACGCTGCCGGTTGATTTATGGGCCAGAGGCCCCAATCCTTGAAAAC
ACTTACGAACAGAGGGTATGA
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protein sequence of evm.model.chr2.1_tiancheng.2275_cs-GNU_v1

>evm.model.chr2.1_tiancheng.2275_cs-GNU_v1 ID=evm.model.chr2.1_tiancheng.2275_cs-GNU_v1; Name=evm.model.chr2.1_tiancheng.2275_cs-GNU_v1; organism=Citrus sinensis; type=polypeptide; length=257bp
MPPFMPVSKALGSLVSRTTGSRHLISSVKSDGQLRMLNQFRRLCGITGIE
TSSVHKLIGTHQNISSSLANFCQNNGNVLQRRRFLGVGDGEEGDVLSKVY
EERRVLGYSPEQLFDVVAAVDLYHGFVPWCQRSEILKHNPDGSFDAELEI
GFKFLVESYVSHVELNRPKFVKTTASDSSLFDHLINIWEFNPGPSPGTCN
LYFLVDFKFHSPLYRQAASMFFKEVVSRLVGSFSERCRLIYGPEAPILEN
TYEQRV*
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mRNA from alignment at chr2.1_tiancheng:34678414..34681331+

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
> ID=; Name=; organism= ; type=; length=2918bp; location=Sequence derived from: chr2.1_tiancheng:34678414..34681331+ (Citrus sinensis
TCATTTAAAAAAAAAAAGGAACAATAATAAAATACACGTCTGAGTAAAGG TACCGGAACAGCCGTACAGCTGTTATCTCGGCGGCGACACCAAAATCATG GCAAGAAAATTAAAGGCGACGTGTAACAGTCTTAATATTTATTATTATTA GTACAAGAATTTTTCTTTTTTTTAAAAAAAAATTATTTTCTTTTTCTTTC TTTACAACTTTCTAATTTTTAAAGAAAGACGACACGCATCTCCTCAGATT CCGCTCATTGTCCAATTTATTTCATTCCTCAGAAAGTCGCCTCGCTGGTT TTGAAAGGTAGGCTATGCTCCTCGCTTTCCTTGATTATCTCGACTCGATC TCTAGGGTTTCGATTTTTCCCTTTTTATATTTGTTCGATTTCCTAACTAA TTGATATATTTTTTTTTCAATAGTTATAGCTTGCTTTGGTTTCCGGGATT TGTGGAATCCCGGCTCTGTCCATAATTATAACCAATTGTTGGAGTAGGGC TTAGAAATTGTGAGATATTACAATGCCGCCATTCATGCCGGTCTCAAAAG CCTTGGGTTCCTTAGTTTCACGTACAACGGGCAGTAGACATTTGATTAGT TCTGTCAAAAGCGATGGGCAGCTACGTATGCTCAATCAGTTTCGACGATT GTGTGGAATAACAGGGATCGAAACATCTTCAGTCCATAAATTGATTGGTA CTCACCAAAATATTAGTTCTTCATTAGCTAATTTTTGCCAAAATAATGGT AATGTTCTGCAAAGGAGGCGGTTTCTTGGTGTCGGAGACGGGGAAGAGGG TGATGTCTTATCCAAAGTTTATGAAGAGCGACGTGTTTTAGGGTAATTTT GCTTGAAACTCTTTTGTTTTTGTTTCTGGTAATCAACTTGAATTTCCTTG TTCATTATTCATTTCCTAAGTTTAATTCTTCAGTATGCATGATTGTGGAA GAAAATTCTTGAATTTACTTCCTCATGGTTGCAGCATATATTTTTTCTGC CCCTTAATGATTTTTTGTATTGGATTTTCATTAGCTGATATATCTTTTCA ATTCCAGCTACTCTCCGGAGCAGTTATTTGATGTAGTTGCTGCTGTTGAT TTGTATCACGGGTTTGTCCCCTGGTGTCAGCGGTCAGAGATACTGAAACA CAACCCAGATGGATCTTTTGATGCCGAGTTGGAGATTGGGTTTAAATTTC TTGTTGAAAGTTATGTTTCCCACGTGGAGTTAAACAGACCAAAGTTCGTT AAGGTAACAAGATGTGAAACTGTTTAGTGGGTTTTCCTTTTTCTTGGACT CCATTTTTGTGATGCACAGAGTGTTCATTCTCGTCTTTAAAGAAAATGTG CCATTTTGAGACAAGCAGGACATGCATTTCGGGGCTGTGAACATGTTGTT CAAATGATTGCTTCTTGCATCGCTACTGCTTAAGTCCAAACTTCTCATTA ATTTAACTTTGGTCCTAGTAGATTGTTGTACTATAATACACTGATCGTTC ATTCTTCTATTTATATAAATGCTCTACTTCATACCAACAGGATATGCAGT TAAGAGTTGTAAACACGGTGTATCAATTGGAGTTCTTCTTGTGTACCTAC TGCTTTAGTTCAAACTTCTTGTTAACTGTGCAATTCTTGCTCTATACCTT TTTGAATTGAGATCGAGATGAAAGTCTTAAATGTAGGATATTGCTGCTAG CTTTACCATGAAATGGAATAAAAGATGAAATATGACCACCTACTCCGAGC CAGTAGGTGCAATGGTGGAGTCATTTGTTGGTCATTTCATTTTTGCGACA TCTTAGAACTCTAAGACGGTCCTTACTGTAGGTGATTTTGATTTCCAAAT GTTTTCTCCTTTTGGCTGTTGAATTTTGATGGTCTTAAATTTTTGTTCTG CTTTATTTTACAGACAACTGCATCAGACAGTTCCCTTTTTGACCATCTAA TAAATATTTGGGAATTCAATCCTGGACCTTCTCCTGGAACTTGCAACCTG TACTTTTTGGTGGATTTTAAGTTTCACTCACCACTTTATCGACAGGTAAT GGTCCTTCATTTGGTTTTTCATATCATGCTTTGCCAATAGTGAGGAACAA AGTTGGAAGGCAATTCAGCAATTTAACTTCTAGAGGGATATGAATTACCA AAATTCCATAGGTTTTGCAAAAAATTGAAAGTAATTGCGGGCATGCTCTT TTAAAGTAGTTCATAGGATCAAGTTAGGAATAATCTCTCTCTCTCTCTAT TTTTGTTTGGAATGAACTGAAACCGGAGGCAAACCAATTGCTCGGTAAAA AATGGAAACAAAATGTTAACCAATTTCTGGGGAAAAACCAAACGGAACTA CCAGTTCAATTCAGTTCTGTCAGTTTAGTGTGGTTGTGTGTAAACTTTGT CCACCCCCTCTTGTAACTTGAAAGGATATTAGCATTGTTGAATCTTTTAC TATACTTATGAAGAGAAGCATGAAGGATGCTAATTTTGCTGAGGGCTCTG CTTAACAGGCAGCGTCTATGTTCTTTAAGGAGGTGGTCTCTCGATTGGTT GGCTCGTTCAGTGAACGCTGCCGGTTGATTTATGGGCCAGAGGCCCCAAT CCTTGAAAACACTTACGAACAGAGGGTATGAAGATTGGTTTTTCCATTCA ATCAGGTTGCTGCTGATTGAATGTCATCCTCCAAAGAGCAGTCTGAATGC TGGTGAGATCAAACAAAAAATGATCTGACAATGTGAAACTGGCACTGGGT GGTTTTAGTTGTGTATCCTTCCCAGCTATTGATCTTTCAAATGGTCATAA ATGGCTCTTAATCAGTCATTTCTATTTTTCCCTTGTCAATCCACCTTTTA TTGATAACTTAGATGTGGCATCTTTGATATATGCGATGGTAAACTCTACT TGGTTTTTTTTTTTTTTT
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Coding sequence (CDS) from alignment at chr2.1_tiancheng:34678414..34681331+

>evm.model.chr2.1_tiancheng.2275_cs-GNU_v1 ID=evm.model.chr2.1_tiancheng.2275_cs-GNU_v1; Name=EVM_prediction_chr2.1_tiancheng.2275; organism=Citrus sinensis; type=CDS; length=771bp; location=Sequence derived from: chr2.1_tiancheng:34678414..34681331+ (Citrus sinensis
ATGCCGCCATTCATGCCGGTCTCAAAAGCCTTGGGTTCCTTAGTTTCACG
TACAACGGGCAGTAGACATTTGATTAGTTCTGTCAAAAGCGATGGGCAGC
TACGTATGCTCAATCAGTTTCGACGATTGTGTGGAATAACAGGGATCGAA
ACATCTTCAGTCCATAAATTGATTGGTACTCACCAAAATATTAGTTCTTC
ATTAGCTAATTTTTGCCAAAATAATGGTAATGTTCTGCAAAGGAGGCGGT
TTCTTGGTGTCGGAGACGGGGAAGAGGGTGATGTCTTATCCAAAGTTTAT
GAAGAGCGACGTGTTTTAGGCTACTCTCCGGAGCAGTTATTTGATGTAGT
TGCTGCTGTTGATTTGTATCACGGGTTTGTCCCCTGGTGTCAGCGGTCAG
AGATACTGAAACACAACCCAGATGGATCTTTTGATGCCGAGTTGGAGATT
GGGTTTAAATTTCTTGTTGAAAGTTATGTTTCCCACGTGGAGTTAAACAG
ACCAAAGTTCGTTAAGACAACTGCATCAGACAGTTCCCTTTTTGACCATC
TAATAAATATTTGGGAATTCAATCCTGGACCTTCTCCTGGAACTTGCAAC
CTGTACTTTTTGGTGGATTTTAAGTTTCACTCACCACTTTATCGACAGGC
AGCGTCTATGTTCTTTAAGGAGGTGGTCTCTCGATTGGTTGGCTCGTTCA
GTGAACGCTGCCGGTTGATTTATGGGCCAGAGGCCCCAATCCTTGAAAAC
ACTTACGAACAGAGGGTATGA
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