orange1.1g013275m.v1.1, orange1.1g013275m.v1.1_Csinensis_154_v1.1 (mRNA) Citrus sinensis

Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence

>orange1.1g013275m.v1.1_Csinensis_154_v1.1 ID=orange1.1g013275m.v1.1_Csinensis_154_v1.1; Name=orange1.1g013275m.v1.1; organism=Citrus sinensis; type=mRNA; length=4427bp
TGATAGATTACAAAGGCGCCAAGCTTTGCTTTTTCAATAAGAAAGTACAG
CGTCTGGGGGCATTTAGGTCAGAGCAAATCAAATTATGTTGATACATAAG
AATTTGAAACAAAACCGATTAATGCTGAGCGGGGCAGAGGAGATGCGTCT
GGTCTGAGTCTGATTTTCTCCTCCTACTCTTGGCTAACTGTAATAAAATT
TTACTTCAATTGATTATCATCGTCAATTCATTCAGATTGAGTAAAGAGTG
GTTGAGTGAggaGGGGACTGAGGATGAGCTCGACGCCAGGAACACACTCG
CTAGCCTTCAGAGTGATGAGGCTATGTAGGCCGTCGTTACACGTGGAGCC
TCCTCTTCGCGTAGACCCCACCGATCTCTTCATCGGCGAGGACATCTTCG
ACGATCCAATCGCCGCTTCCAACCTCCCTCCACTAATATCTAGCGACGTC
ACCACCAACAAATCCTCCGATCTCACCTATCGCTCTAGATTCCTCCTCCA
CGACTCCGCTGATTCCATCGGCCTCTCCGGCCTCCTCGTCCTCCCCcAAG
CcTTCGGgTCCcTATTCCcTTTtAATTTTtCTTtCCctAATTTTTTTTTt
tAAaTTATAATTATTCATTTTCTTTTTtGTTAAATTATGATTAACAGGGC
TATTTATCTGGGAGAGACGTTTTGTAGCTACATTAGTATCAACAACAGTT
CCACTTTAGAAGTTAGAGATGTTGTTATTAAGGTATTTTTTTTtttCAAT
AATTTCATTGCAAATGAAGAGGTCAATAATTTCATTTCAAATGAAGGACA
TATTTAGCTTGAATAAAAAATAAAAAAaTTAATTATTTCCATTAAATAGG
CAGAAATTCAAACGGATAAGCAGAGGATCCTCCTTTTGGATACGTCAAAA
TCACCTGTTGAATCAATACGAGCGGGCGGACGTTATGATTTCATCGTAGA
ACATGATGTCAAAGAACTCGGAGCTCATACGTTAGTATTAATCTGATTTT
TTGGTTTCTTTATTTTGTTTATGAATTATGCATCCATCACCTCTGATGTC
AATCATTTTGAATTTGTTTAGGCTTGTGTGCACGGCATTGTATAGTGATG
GTGAGGGAGAGCGGAAATATCTTCCACAGTTTTTCAAGTTCATTGTCTCC
AATCCACTTTCAGTTCGGACCAAGGTATTAGCTTGAAATCGATTTCATGA
ACCAATGCGAGGTGTGTATTTTGTTTCTTGCCCAAAGTTAATACTTGTTt
ACTATGACTTCATTCTGCAGGTCCGTGTTGTTAAGGTAGGTGCAACGCAT
TTTCAGGTGTAAGTTGTAATATCTTATTCTGTTTTTATCAGAGTTTCAAG
AAATTGTGGTGACGACTGCTGCCTTTGGAAAACACATTATGATAACTGTT
TTCTGTGTCAGGAAATAACATTTTTAGAGGCATGCATTGAGAATCATACA
AAATCAAACCTTTATATGGACCAAGTTGAGTTTGAGCCTTCTCAGAATTG
GAGTGCAACAATGCTTAAAGCTGATGGACCCCATTCTGATTACAATGCCC
AAAGTAGGTATGTCCGGATAAAATATACTGGGTATTTTGAATCGAAGATT
TGTTCTGTGTTTCGCTTCATTATTAAATATTTTTtAATTCAATTTTCATG
TACATTTGTTATTTACAAAATCTGATCTCCCGTGCTTTTCTTTTTATTGA
TTTATCATATTCTGGCAGAGAGATATTTAAGCCACCAGTACTCATCAGAT
CTGGTGGAGGGATTCACAACTATCTATATCAGTTAAAAATGTTGTCACAT
GGTTCTTCCTCACCAGTGAAAGTTCAAGgAAGTAATGTTCTTGGTAAACT
TCAAATAACATGGCGTACAAATTTGGGTGAACCTGGTCGCCTACAGACAC
AGCAAATTCTTGGCACCGTAAGTGCATTCTTTAATAATTGAAGAACGTGA
AAGCTTAAAAATTGTTCAGATGAGATTTATTGAACATAAAGCTATAGTAA
AACAAAGCTAAAACTCTTAGAGGGGGAAAAGAAAATTCCGAATCTAATAA
ATGAGATATTTATAAAATCACAGATCTAATAAACTCAGCAGATTAAGAGT
CAGATAACAATGAAATTTCAAAAAAGATTAATAATTTGTTTCAATTCTAG
AAAAAAAGAGTGCGAAAGAGATGTTACATAGAATTTGATTGGGTGCAGCA
TAATTGAATTTAAATTTAAAGGTTTTCAGAAATTTTCACTCGTATGCAAC
AGATTTCTCTGCAATCTCAGTATGTATGGTGTATGGAAATGCTATTATTT
GGTGGATGTTGTCCTTAGTGTCTTAAAACTTCCATTTACAGACCATCACT
AGCAAGGAGATTGAGCTGAATGTTGTGGAGGTTCCTTCTGTTGTCGGCAT
AGATAAACCATTCTTGGTAATTAGCATTTCAATTTCATAACATTTTGCTT
ATGAATTCCAGTGTACCCTCTTCAGTAAATATCATTCATTTCTAATGTTC
ATTCATATGGTATCATCTTTGGATTTGAACTCAACTTTCCTTTTATGTGG
CCTATGGTTTCAAGTCCATATGGTATCCTCTTTGGATTAATTTCTTCAAC
CGTTAGTGCTGCACCAAGCTAGTGTTGGTTTGAAAGTTAAACTGAAGTAG
TCAGTGGTTGATGCAGTTAAAGTTAAAGCTCACAAACCAGACGGACAAAG
AACAGGGCCCCTTTGAAATTTGGCTATCACAAAATGATTCAGATGAGGAG
AAAGTTGTTATGATTAACGGTCTTCGGATAATGGTAACACAATTTGGTTG
GCTGATAGAAACCATTTTTATGTGGATATCCCTGATTTATTCATGACCCT
TCAGTTTATAGAAATACTGATTTCTTCCATTACTGATATATATGGTTTTG
ACTGTGTACAGGCATTAGCACCAGTGGAGGCTTTTGGTTCCACAGATTTT
CACTTGGTATGAACAAGATTCTTGTGATAAGTATTCCCCTCCCCTCCCcT
CCCCCCCCTCCCcACCCCCTTCTTTTCATTTGAGATGTTGAAGAGACGAC
CATACTGTGTATCCCATGCTGTACTTTTGATTGTTTCATTTTCTCTAACC
AATTCAATTGTGCTGTCTTTTTGTATGCAGAATCTGATTGCAACGAAACT
TGGAGTTCAAAGAATCACTGGCATTACAGTGTTCGACAAGTTAGAGAAGA
TAACCTATGACTCTTTGCCTGATTTAGAGGTTGGTGATCTATGGTTCTTA
GCACTGTTCATCAGAGATTAGTGTTAAGTGCTCTGTGTTCTAAAATCTGG
TTTGTCCAACTTCGGTAATACTGCAGAGTTGTAATGTCTGAGAATCTCAG
CtAAGTGGTTGGTTGCTGAGTTATCTCAGAATTGAATAAAATTGGGAAAG
TTTGAATGAGCATTAATGCATGAAAACATATTTGGAACCTTGATTTTGGT
AAAATCTTATATTGGAATAGTAATATGGAATATTTTGGCACAGTAAGAAT
TGTAAAGCTGAGGAGAGGCTACTGGAAGTGCTGCAGAACTCTTGGCCTGC
AAAGAGTAGGCCTCCATGTTTTGAGTGCAACATTTAATTGAAACACACTT
ATAGTCGAGAACTTGTCCAAATCATCTTTCAAAAAaCACTAGTTTTGTGA
ATGTCGGGTGATCTTGATAGATGCTTTAATGCTTCAAATTGATCAGTTGA
TTTAGTATCTCGAATCTGAAAGAATATATaTTTTTTTTTTtACTGCCCTA
GCTATAAAATTGACATGATCCATTTCATGTTGATGGTTGGTTCTGCTTCA
TTGATAATTTGCTGTCTTTGCGGTCTTTGTGATGCACAGTGTTTTTGATG
GATTGATTTTCtGATCTTTCTGAACACATTGCAGATTTTTGTGGATCAGG
ATTGATAAGTTGGCTGGTTTTGGCCCGTTAAGTTTGCAGAGACTGAACTA
ACACCATTTGGTTTTTGAGGAGTTTTGGTGACTGAGCATTGTCGTGACAT
ACCCCATCAGTTTGGCTTTTACTAAATCACTCAGAACTACAGCCAgTGAG
CCCCAAGTTCATCTAGCTTCTTGACTGCTAGAGAGCTATATTCAATTTCC
ACGCAAAGTACCTGCTTGCTGCTTTTATATGAACTTATTCTGTTGTTTCA
AGGGCAAGGCAGATTATTTTCTTTGTGGTTGACCATGTGATTTTGATTAC
TAAAATTATCAAACGCCAAGTCATGTGGTACTGGCGGTGGGTTGGGTTTT
ATTTTAAATGGGTGGGCTAAGTGAAATTCTATTATGAAGCTGGGGTGTAT
TTTATGGATCACCAACACTTGTGATACCAAACCAGTTATTTTAAGAATAG
TTGTTAAGTCAGTTATTTGGTTCTTTTAAGAATAGTTGTTAAATCTGTTA
TGTATCTAAAGAAAATGAATTTCGTGT
back to top

mRNA from alignment at scaffold00010:2025933..2030359+

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
> ID=; Name=; organism= ; type=; length=4427bp; location=Sequence derived from: scaffold00010:2025933..2030359+ (Citrus sinensis
TGATAGATTACAAAGGCGCCAAGCTTTGCTTTTTCAATAAGAAAGTACAG CGTCTGGGGGCATTTAGGTCAGAGCAAATCAAATTATGTTGATACATAAG AATTTGAAACAAAACCGATTAATGCTGAGCGGGGCAGAGGAGATGCGTCT GGTCTGAGTCTGATTTTCTCCTCCTACTCTTGGCTAACTGTAATAAAATT TTACTTCAATTGATTATCATCGTCAATTCATTCAGATTGAGTAAAGAGTG GTTGAGTGAggaGGGGACTGAGGATGAGCTCGACGCCAGGAACACACTCG CTAGCCTTCAGAGTGATGAGGCTATGTAGGCCGTCGTTACACGTGGAGCC TCCTCTTCGCGTAGACCCCACCGATCTCTTCATCGGCGAGGACATCTTCG ACGATCCAATCGCCGCTTCCAACCTCCCTCCACTAATATCTAGCGACGTC ACCACCAACAAATCCTCCGATCTCACCTATCGCTCTAGATTCCTCCTCCA CGACTCCGCTGATTCCATCGGCCTCTCCGGCCTCCTCGTCCTCCCCcAAG CcTTCGGgTCCcTATTCCcTTTtAATTTTtCTTtCCctAATTTTTTTTTt tAAaTTATAATTATTCATTTTCTTTTTtGTTAAATTATGATTAACAGGGC TATTTATCTGGGAGAGACGTTTTGTAGCTACATTAGTATCAACAACAGTT CCACTTTAGAAGTTAGAGATGTTGTTATTAAGGTATTTTTTTTtttCAAT AATTTCATTGCAAATGAAGAGGTCAATAATTTCATTTCAAATGAAGGACA TATTTAGCTTGAATAAAAAATAAAAAAaTTAATTATTTCCATTAAATAGG CAGAAATTCAAACGGATAAGCAGAGGATCCTCCTTTTGGATACGTCAAAA TCACCTGTTGAATCAATACGAGCGGGCGGACGTTATGATTTCATCGTAGA ACATGATGTCAAAGAACTCGGAGCTCATACGTTAGTATTAATCTGATTTT TTGGTTTCTTTATTTTGTTTATGAATTATGCATCCATCACCTCTGATGTC AATCATTTTGAATTTGTTTAGGCTTGTGTGCACGGCATTGTATAGTGATG GTGAGGGAGAGCGGAAATATCTTCCACAGTTTTTCAAGTTCATTGTCTCC AATCCACTTTCAGTTCGGACCAAGGTATTAGCTTGAAATCGATTTCATGA ACCAATGCGAGGTGTGTATTTTGTTTCTTGCCCAAAGTTAATACTTGTTt ACTATGACTTCATTCTGCAGGTCCGTGTTGTTAAGGTAGGTGCAACGCAT TTTCAGGTGTAAGTTGTAATATCTTATTCTGTTTTTATCAGAGTTTCAAG AAATTGTGGTGACGACTGCTGCCTTTGGAAAACACATTATGATAACTGTT TTCTGTGTCAGGAAATAACATTTTTAGAGGCATGCATTGAGAATCATACA AAATCAAACCTTTATATGGACCAAGTTGAGTTTGAGCCTTCTCAGAATTG GAGTGCAACAATGCTTAAAGCTGATGGACCCCATTCTGATTACAATGCCC AAAGTAGGTATGTCCGGATAAAATATACTGGGTATTTTGAATCGAAGATT TGTTCTGTGTTTCGCTTCATTATTAAATATTTTTtAATTCAATTTTCATG TACATTTGTTATTTACAAAATCTGATCTCCCGTGCTTTTCTTTTTATTGA TTTATCATATTCTGGCAGAGAGATATTTAAGCCACCAGTACTCATCAGAT CTGGTGGAGGGATTCACAACTATCTATATCAGTTAAAAATGTTGTCACAT GGTTCTTCCTCACCAGTGAAAGTTCAAGgAAGTAATGTTCTTGGTAAACT TCAAATAACATGGCGTACAAATTTGGGTGAACCTGGTCGCCTACAGACAC AGCAAATTCTTGGCACCGTAAGTGCATTCTTTAATAATTGAAGAACGTGA AAGCTTAAAAATTGTTCAGATGAGATTTATTGAACATAAAGCTATAGTAA AACAAAGCTAAAACTCTTAGAGGGGGAAAAGAAAATTCCGAATCTAATAA ATGAGATATTTATAAAATCACAGATCTAATAAACTCAGCAGATTAAGAGT CAGATAACAATGAAATTTCAAAAAAGATTAATAATTTGTTTCAATTCTAG AAAAAAAGAGTGCGAAAGAGATGTTACATAGAATTTGATTGGGTGCAGCA TAATTGAATTTAAATTTAAAGGTTTTCAGAAATTTTCACTCGTATGCAAC AGATTTCTCTGCAATCTCAGTATGTATGGTGTATGGAAATGCTATTATTT GGTGGATGTTGTCCTTAGTGTCTTAAAACTTCCATTTACAGACCATCACT AGCAAGGAGATTGAGCTGAATGTTGTGGAGGTTCCTTCTGTTGTCGGCAT AGATAAACCATTCTTGGTAATTAGCATTTCAATTTCATAACATTTTGCTT ATGAATTCCAGTGTACCCTCTTCAGTAAATATCATTCATTTCTAATGTTC ATTCATATGGTATCATCTTTGGATTTGAACTCAACTTTCCTTTTATGTGG CCTATGGTTTCAAGTCCATATGGTATCCTCTTTGGATTAATTTCTTCAAC CGTTAGTGCTGCACCAAGCTAGTGTTGGTTTGAAAGTTAAACTGAAGTAG TCAGTGGTTGATGCAGTTAAAGTTAAAGCTCACAAACCAGACGGACAAAG AACAGGGCCCCTTTGAAATTTGGCTATCACAAAATGATTCAGATGAGGAG AAAGTTGTTATGATTAACGGTCTTCGGATAATGGTAACACAATTTGGTTG GCTGATAGAAACCATTTTTATGTGGATATCCCTGATTTATTCATGACCCT TCAGTTTATAGAAATACTGATTTCTTCCATTACTGATATATATGGTTTTG ACTGTGTACAGGCATTAGCACCAGTGGAGGCTTTTGGTTCCACAGATTTT CACTTGGTATGAACAAGATTCTTGTGATAAGTATTCCCCTCCCCTCCCcT CCCCCCCCTCCCcACCCCCTTCTTTTCATTTGAGATGTTGAAGAGACGAC CATACTGTGTATCCCATGCTGTACTTTTGATTGTTTCATTTTCTCTAACC AATTCAATTGTGCTGTCTTTTTGTATGCAGAATCTGATTGCAACGAAACT TGGAGTTCAAAGAATCACTGGCATTACAGTGTTCGACAAGTTAGAGAAGA TAACCTATGACTCTTTGCCTGATTTAGAGGTTGGTGATCTATGGTTCTTA GCACTGTTCATCAGAGATTAGTGTTAAGTGCTCTGTGTTCTAAAATCTGG TTTGTCCAACTTCGGTAATACTGCAGAGTTGTAATGTCTGAGAATCTCAG CtAAGTGGTTGGTTGCTGAGTTATCTCAGAATTGAATAAAATTGGGAAAG TTTGAATGAGCATTAATGCATGAAAACATATTTGGAACCTTGATTTTGGT AAAATCTTATATTGGAATAGTAATATGGAATATTTTGGCACAGTAAGAAT TGTAAAGCTGAGGAGAGGCTACTGGAAGTGCTGCAGAACTCTTGGCCTGC AAAGAGTAGGCCTCCATGTTTTGAGTGCAACATTTAATTGAAACACACTT ATAGTCGAGAACTTGTCCAAATCATCTTTCAAAAAaCACTAGTTTTGTGA ATGTCGGGTGATCTTGATAGATGCTTTAATGCTTCAAATTGATCAGTTGA TTTAGTATCTCGAATCTGAAAGAATATATaTTTTTTTTTTtACTGCCCTA GCTATAAAATTGACATGATCCATTTCATGTTGATGGTTGGTTCTGCTTCA TTGATAATTTGCTGTCTTTGCGGTCTTTGTGATGCACAGTGTTTTTGATG GATTGATTTTCtGATCTTTCTGAACACATTGCAGATTTTTGTGGATCAGG ATTGATAAGTTGGCTGGTTTTGGCCCGTTAAGTTTGCAGAGACTGAACTA ACACCATTTGGTTTTTGAGGAGTTTTGGTGACTGAGCATTGTCGTGACAT ACCCCATCAGTTTGGCTTTTACTAAATCACTCAGAACTACAGCCAgTGAG CCCCAAGTTCATCTAGCTTCTTGACTGCTAGAGAGCTATATTCAATTTCC ACGCAAAGTACCTGCTTGCTGCTTTTATATGAACTTATTCTGTTGTTTCA AGGGCAAGGCAGATTATTTTCTTTGTGGTTGACCATGTGATTTTGATTAC TAAAATTATCAAACGCCAAGTCATGTGGTACTGGCGGTGGGTTGGGTTTT ATTTTAAATGGGTGGGCTAAGTGAAATTCTATTATGAAGCTGGGGTGTAT TTTATGGATCACCAACACTTGTGATACCAAACCAGTTATTTTAAGAATAG TTGTTAAGTCAGTTATTTGGTTCTTTTAAGAATAGTTGTTAAATCTGTTA TGTATCTAAAGAAAATGAATTTCGTGT
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold00010:2025933..2030359+

>orange1.1g013275m.v1.1_Csinensis_154_v1.1 ID=orange1.1g013275m.v1.1_Csinensis_154_v1.1; Name=orange1.1g013275m.v1.1; organism=Citrus sinensis; type=CDS; length=1341bp; location=Sequence derived from: scaffold00010:2025933..2030359+ (Citrus sinensis
ATGAGCTCGACGCCAGGAACACACTCGCTAGCCTTCAGAGTGATGAGGCT
ATGTAGGCCGTCGTTACACGTGGAGCCTCCTCTTCGCGTAGACCCCACCG
ATCTCTTCATCGGCGAGGACATCTTCGACGATCCAATCGCCGCTTCCAAC
CTCCCTCCACTAATATCTAGCGACGTCACCACCAACAAATCCTCCGATCT
CACCTATCGCTCTAGATTCCTCCTCCACGACTCCGCTGATTCCATCGGCC
TCTCCGGCCTCCTCGTCCTCCCCcAAGCcTTCGGGGCTATTTATCTGGGA
GAGACGTTTTGTAGCTACATTAGTATCAACAACAGTTCCACTTTAGAAGT
TAGAGATGTTGTTATTAAGGCAGAAATTCAAACGGATAAGCAGAGGATCC
TCCTTTTGGATACGTCAAAATCACCTGTTGAATCAATACGAGCGGGCGGA
CGTTATGATTTCATCGTAGAACATGATGTCAAAGAACTCGGAGCTCATAC
GCTTGTGTGCACGGCATTGTATAGTGATGGTGAGGGAGAGCGGAAATATC
TTCCACAGTTTTTCAAGTTCATTGTCTCCAATCCACTTTCAGTTCGGACC
AAGGTCCGTGTTGTTAAGGTAGGTGCAACGCATTTTCAGGAAATAACATT
TTTAGAGGCATGCATTGAGAATCATACAAAATCAAACCTTTATATGGACC
AAGTTGAGTTTGAGCCTTCTCAGAATTGGAGTGCAACAATGCTTAAAGCT
GATGGACCCCATTCTGATTACAATGCCCAAAGTAGAGAGATATTTAAGCC
ACCAGTACTCATCAGATCTGGTGGAGGGATTCACAACTATCTATATCAGT
TAAAAATGTTGTCACATGGTTCTTCCTCACCAGTGAAAGTTCAAGgAAGT
AATGTTCTTGGTAAACTTCAAATAACATGGCGTACAAATTTGGGTGAACC
TGGTCGCCTACAGACACAGCAAATTCTTGGCACCACCATCACTAGCAAGG
AGATTGAGCTGAATGTTGTGGAGGTTCCTTCTGTTGTCGGCATAGATAAA
CCATTCTTGTTAAAGTTAAAGCTCACAAACCAGACGGACAAAGAACAGGG
CCCCTTTGAAATTTGGCTATCACAAAATGATTCAGATGAGGAGAAAGTTG
TTATGATTAACGGTCTTCGGATAATGGCATTAGCACCAGTGGAGGCTTTT
GGTTCCACAGATTTTCACTTGAATCTGATTGCAACGAAACTTGGAGTTCA
AAGAATCACTGGCATTACAGTGTTCGACAAGTTAGAGAAGATAACCTATG
ACTCTTTGCCTGATTTAGAGATTTTTGTGGATCAGGATTGA
back to top